Záštitu nad Nocí kostelů 2009 převzali
Mons. Vojtěch Cikrle, biskup brněnský, Mons. František Radkovský, biskup plzeňský
Mgr. Michal Hašek, hejtman Jihomoravského kraje
Blansko
Brno-město
Břeclav
Třebíč
Vyškov
Domažlice
Plzeň-město
Nymburk
Rakovník